校方每學期將頒發優秀學生書卷獎，並提供獎學金。本系向系友爭取募款，每年亦由管理費提撥獎助學金，近年來編列的獎助學金總金額持續增加。其他還有由校友、企業或民間熱心人士提供的校內、外獎學金供學生申請，相關申請資訊請參閱如下:
 

一、新生獎學金

新生獎學金有大學部新生入學成績優異獎學金等，詳細規定請參照招策中心網頁。

二、校內獎學金：

目前每學年提供給本系優秀學生的獎學金如下：

1、 財團法人水木化學獎學金

2、 化學系78級何智雄紀念獎學金

3、 劉高家秀紀念獎學金

4、 理學院菁英獎學金

5、 吳仲亞先生獎學金

6、 許成己先生紀念獎助學金

7、 陳仲治先生紀念獎學金

8、 陶祖成女士紀念獎學金

9、 Eric K. Parks and Plato C. Lee 獎學金

另有其它獎學金可供申請。請參閱本系獎學金網站。

三、校外獎學金：

校外獎學金眾多，請參閱本校生輔組網站